男性生殖器长水疱应就诊皮肤科或泌尿科。
男性生殖器出现水疱，是一种常见的皮肤黏膜症状，可能由多种原因引起。患者在发现此类症状时，应及时前往正规医院的皮肤科或泌尿科就诊，以便准确诊断与及时治疗。
生殖器水疱的成因复杂，以下五点为可能的原因及相应治疗方式：
1、生殖器疱疹由单纯疱疹病毒（HSV）感染引起，表现为生殖器部位簇集性水疱，易破溃形成糜烂或溃疡。治疗常用抗病毒药物如阿昔洛韦、伐昔洛韦等，局部可涂抹阿昔洛韦乳膏。
2、接触性皮炎由于生殖器接触到刺激性物质（如化学物质、植物汁液等）引起的炎症反应。治疗需避免再次接触刺激物，并使用抗过敏药物如氯雷他定、西替利嗪等。
3、药疹某些药物使用后可能引发皮肤过敏反应，导致水疱形成。治疗时需停用致敏药物，使用抗过敏药如扑尔敏、苯海拉明等。
4、包皮龟头炎包皮过长或包茎的男性，因包皮垢刺激或细菌感染，可能导致龟头及包皮内板出现炎症，形成水疱。治疗需保持局部清洁，使用抗生素如红霉素软膏、莫匹罗星软膏等。
5、其他罕见疾病如天疱疮、类天疱疮等自身免疫性疾病，也可能导致生殖器水疱。这类疾病需由专业医生进行详细检查和系统治疗。
综上所述，男性生殖器长水疱的原因多样，治疗方法各异。患者应根据医生建议，进行针对性治疗，切勿自行用药，以免延误病情。
