细胞质基质由水、无机盐、脂质、糖类、核苷酸、氨基酸等组成。
细胞质基质又称胞质溶胶,是细胞质中均质而半透明的胶体部分,充填于其他有形结构之间,是活细胞进行新陈代谢的场所。细胞质基质的化学组成可按其相对分子质量大小分为三类,即小分子、中分子和大分子。小分子由水、无机盐等组成;中分子由脂质、糖类、氨基酸、核苷酸及其衍生物等组成;大分子则由多糖、蛋白质、脂蛋白和RNA等组成。
细胞质基质是细胞的重要的结构成分,其体积约占细胞质的一半。细胞与环境,细胞质与细胞核,以及细胞器之间的物质运输、能量交换、信息传递等都要通过细胞质基质来完成,很多重要的中间代谢反应也在细胞质基质中进行,如糖酵解过程、磷酸戊糖途径、糖醛酸途径、糖原的合成与部分分解过程等。