孩子起床尿液浑浊而且腰痛可能是肾盂肾炎、肾病综合征、输尿管结石等疾病导致，可以在医生的指导下应用药物治疗或者通过手术的方式治疗。
1、肾盂肾炎：本病的发病原因主要与病原体感染有关。患病后可导致病原体在泌尿系统中异常繁殖，导致小便浑浊，患病后炎症还会对肾盂局部进行刺激，引起腰痛。可以在医生的指导下应用阿莫西林颗粒、头孢克肟颗粒、头孢呋辛酯颗粒等药物治疗。
2、肾病综合征：本病的发病原因可能与感染因素有关，也有可能与遗传因素有关，患病后可能会出现大量的蛋白尿，引起尿液浑浊、泡沫增多，患病后还有可能会导致肾脏周围的神经以及腰部神经受到刺激，引起腰痛、肾区疼痛等。可以在医生的指导下应用环孢素软胶囊、醋酸泼尼松龙片、复方环磷酰胺片等药物治疗。
3、输尿管结石：尿路异常、机体代谢改变等因素有可能会引起输尿管结石，患病后有可能会导致输尿管平滑肌痉挛，结石还有可能会刺激周围的黏膜引起腰痛，较小的结石跟随尿液排出时可导致尿液性状发生改变，可行输尿管切开取石术、输尿管硬镜激光碎石术等。
除了以上比较常见的原因以外，也有可能是肾结石引起，可通过体外冲击波碎石术、经皮肾镜碎石取石术等手术方式进行治疗，有利于改善临床症状。
