因为心肌炎毒感染往往与细菌感染同时存在或是相继发生,而且细菌感染常常可使病毒活跃,机体抵抗力降低心脏损害加重,所以适当的应用抗生素及时控制细菌感染十分必要。对于一些易感染的病人比如扁桃体反复发炎的患者,必要使可进行扁桃体摘除术,以去除诱因或是注射转移因子丙种球蛋白等,增强机体抵抗力防止复发。
心肌炎的并发症包括心力衰竭,心律失常甚至休克,对于这些并发症应及时处理,在病毒急性感染的最初十天内,应避免使用激素以免造成病毒扩散病情恶化。近些年来用一些中西医结合的治疗比如黄芪,金银花,辅酶Q10,肌酐等等,有抗病毒调节免疫的功能,对于心肌炎的治疗有一定的疗效。