各种精神疾病,尤其是双相情感障碍躁狂相和精神分裂症失代偿期,都会出现睡眠开始的延迟,但是和睡眠时相延迟综合征不同的是,精神疾病的这种睡眠短,而且是紊乱的,不管何时上床睡觉,总会出现睡眠困难,而在双相情感障碍躁狂相,虽然有入睡延迟,但是没有觉醒困难。
此外,在重症精神障碍的睡眠延迟模式,一般是短暂性的,并且随着精神症状的严重程度变化,精神症状缓解以后,时相延迟睡眠若继续存在,便提示患者有睡眠时相延迟综合征,持续性、病理、生理性失眠,也会出现睡眠时相延迟综合征,但这类患者绝大部分伴有一个睡眠维持问题。