急性肾盂肾炎可以为单侧或者双侧肾脏受累,表现为局限或者广泛的肾盂肾盏黏膜充血,水肿,表面有脓性的分泌物,黏膜下可见细小的脓肿,与一个或者是几个肾乳头可见大小不一,间断指向肾乳头肌底,伸向肾皮质的歇型炎症病灶,病灶内可见不同疼程度的肾小管上皮细胞肿胀,坏死,脱落。
肾小管腔中有脓性分泌物,肾间质水肿内有白细胞浸润和小脓肿形成,炎症剧烈时可以有广泛性的出血,较大的炎症病灶愈合后,局部形成斑痕,肾小球一般无形态学改变,合并有尿路梗阻者,炎症范围常常比较广泛。
慢性肾盂肾炎双侧的肾脏病变常常不一致,肾脏的体积缩小,表面不光滑,有肾盂肾盏黏连,变形,肾乳头疤痕形成,肾小管萎缩以及肾间质淋巴,单核细胞浸润等慢性炎症的表现。