再生障碍性贫血的患者,往往可以发生外周血三系细胞减少,骨髓增生减低或者是重度减低,这一点和阵发性睡眠性血红蛋白尿是相似的。阵发性睡眠性血红蛋白尿的时候,患者也可以发生外周血三系细胞的减少,骨髓当中增生的减低。
如果是有典型的血红蛋白尿发作的时候,比较容易进行鉴别,但是如果没有血红蛋白尿发作的时候,二者是非常容易混淆的。再生障性贫血的患者,除了有贫血以外,患者还可以发生出血和感染,网织红细胞是减低的。
而阵发性睡眠性血红蛋白尿,除了有贫血以外,出血和感染是比较少见的,而且网织红细胞出现增高,骨髓当中幼红细胞增生,而且尿中含铁血黄素,糖水试验以及酸溶血试验是呈阳性反应的。