胃肠道间质瘤有良恶性之分。胃肠道间质瘤是从良性到潜在恶性,再到恶性之间的一种实性肿瘤。世界卫生组织将胃肠间质瘤分为良性,潜在恶性和恶性,良恶性无明显的区分标准,大多认为胃肠间质瘤无良性可言,至少属于低度恶性。
区分胃肠间质瘤良恶性的主要指标有:肿瘤的大小,核分裂象以及部位,据此将胃肠间质瘤分为低度恶性,中度恶性和高度恶性,还有极度恶性胃肠间质瘤。极低危的胃肠间质瘤可视为良性;低危的恶性胃肠间质瘤复发转移的几率很小,可视为潜在恶性胃肠间质瘤;中高危的胃肠间质瘤,即使手术完整切除也有很大的复发风险,可视为恶性的胃肠间质瘤。