肺栓塞通过积极合理的抗凝和或溶栓后大部分能痊愈,较少遗留有后遗症。治愈后出院仍需口服抗凝制剂维持治疗,但临床上也有少数患者产生后遗症例如:部分患者血栓溶解不完全或再发反复发生小的肺栓塞可导致肺血管的狭窄、肺动脉高压形成,从而出现肺心病的改变,患者可有心功能不全的表现,这也是最不理想的后遗症。
还有部分患者有下肢深静脉血栓可导致患肢肿胀、静脉曲张的形成,严重者可导致静脉炎。当患者发生大范围的肺梗死的时候,需经治疗痊愈,但会影响患者的肺功能出现活动后喘闷不适。肺栓塞的后遗症通过积极的治疗和预防血栓的再形成,其临床症状大部分能缓解和控制。